Lehrstuhl für Paläontologie & Geobiologie
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Aquatische Mikrobielle Kohlenstoffkreislauf

Mikroorganismen beeinflussen die Zusammensetzung der Atmosphäre, den Kreislauf von Elementen innerhalb und durch Ökosysteme und die Funktionsweise von Ökosystemen. Mikroorganismen sind auch die metabolisch flexibelsten und taxonomisch und evolutionär vielfältigsten Organismen auf der Erde. Die Entschlüsselung, wie diese Diversität biogeochemische Prozesse in größeren Maßstäben beeinflusst, ist jedoch eine Herausforderung, da es aufgrund der überwältigenden Komplexität mikrobieller Gemeinschaften schwierig ist, zu quantifizieren, wie mikrobielle Taxa Elemente in der Umwelt assimilieren und umwandeln.

Wir verwenden eine Kombination von Methoden, die Traditionen aus der mikrobiellen Ökologie verbinden, einschließlich stabiler Isotopen Markierungen, Genom- und Genexpression Methoden, um zu untersuchen, wie die Diversität und Physiologie von Mikroorganismen die Biogeochemie mariner Ökosysteme beeinflusst. Unsere Forschung basiert hauptsächlich auf Feldbeobachtungen sowie DNA- und RNA-stabilen Isotopenmarkierungsexperimenten. Unsere Forschung konzentriert sich hauptsächlich auf die biologischen und biochemischen Mechanismen, die marinen mikrobiellen Kreisläufen zugrunde liegen: dem biogeochemischen Kreislauf von Kohlenstoff und seiner Verarbeitung durch mikrobielle Nahrungsnetze im Ozean.

Schlüsselpublikationen

  • Einsiedl F, Wunderlich A, Sebilo M, Coskun ÖK, Orsi W, Mayer B (2020) Biogeochemical evidence of anaerobic methane oxidation and anaerobic ammonium oxidation in a stratified lake using stable isotopes. Biogeosciences (accepted) doi.org/10.5194/bg-2020-18.
  • Ortega-Arbulu AS, Pichler M, Vuillemin A, Orsi W* (2019) Effects of organic matter and low oxygen on the mycobenthos in a coastal lagoon. Environmental Microbiology 21: 374-388.
  • Coskun OK, Pichler M, Vargas S, Gilder S, Orsi W* (2018) Linking uncultivated microbial populations with benthic carbon turnover using quantitative stable isotope probing. Applied and Environmental Microbiology 84(18): e01083-18.
  • Orsi W*, Wilken S, del Campo J, Heger T, James E, Richards TA, Keeling PJ, Worden AZ, Santoro AE (2018) Identifying protist consumers of photosynthetic picoeukaryotes in the surface ocean using stable isotope probing. Environmental Microbiology 20, 815-827
  • Orsi W*, Smith JM, Liu S, Liu Z, Sakamoto CM, Wilken S, Poirier C, Richards TA, Keeling PJ, Worden AZ, Santoro AE (2016) Diverse, uncultivated bacteria and archaea underlying the cycling of dissolved protein in the ocean. The ISME Journal 10, 2158-2173. [Recommended by Faculty of 1000]
  • Orsi W*, Smith JM, Wilcox HM, Swalwell JE, Carini P, Worden AZ, Santoro AE (2015). Ecophysiology of uncultivated marine euryarchaea is linked to particulate organic matter. The ISME Journal 9: 1747-1763.
  • Santoro AE, Dupont CL, Richter RA, Craig MT, Carini P, McIlvin MR, Yang Y, Orsi W, Moran D, Saito MA (2015). Genomic and proteomic characterization of ‘Candidatus Nitrosopelagicus brevis’: an ammonia-oxidizing archaeon from the open ocean. PNAS 114:1173-1178.
  • Orsi W*, Song Y, Hallam S, Edgcomb V. (2012). Effect of oxygen minimum zone formation on communities of marine protists. The ISME Journal 6: 1586-1601.
  • Orsi W*, Edgcomb V, Faria J, Foissner W, Fowle W, Hohmann T, Suarez S, Taylor C, Taylor GT, Vdacny P, Epstein S. (2012). Class Cariacotrichea, a novel ciliate taxon from the anoxic Cariaco Basin, Venezuela; International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 62: 1425-1433.
  • Orsi W*, Edgcomb V, Jeon S O, Leslin C, Bunge J, Taylor G T, Varela R, Epstein S. (2011). Protistan microbial observatory in the Cariaco Basin, Caribbean. Part II. Habitat specialization. The ISME Journal 5:1344-1356.

Kooperationen

Ozeanographische Forschungsfahrt "EreBUS" https://www.ldf.uni-hamburg.de/meteor/wochenberichte.html